Tag : bio2rdf

Il y a 31 jeux de données taggés avec bio2rdf:

• Comprehensive Knowledge Archive Network

  • json
  • api/sparql
  • application/rdf+xml
  • text/n3
  • application/x-ntriples
  • example/n3
  • example/rdf+xml
  • example/ntriples

  • 119 views
  • 
• Saccharomyces Genome Database

  • api/sparql

  • 187 views
  • Pas couvert par une licence ouverte
• PROSITE

  • api/sparql
  • example/rdf+xml

  • 227 views
  • Pas couvert par une licence ouverte
  PROSITE consists of documentation entries describing protein domains, families and functional sites as well as associated patterns and profiles to identify them.
• KEGG Glycan

  • api/sparql
  • application/x-ntriples

  • 121 views
  • Pas couvert par une licence ouverte
• Bio2RDF - ChEBI

  • api/sparql
  • application/x-ntriples

  • 205 views
  • 
  Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) is a freely available dictionary of molecular entities focused on ‘small’ chemical compounds. The term ‘molecular entity’ refers to any...
• OMIM

  • api/sparql
  • application/x-ntriples
  • application/x-nquads

  • 525 views
  • Pas couvert par une licence ouverte
• Bio2RDF - InterPro

  • api/sparql
  • example/rdf+xml

  • 197 views
  • Pas couvert par une licence ouverte
  InterPro is a database of protein families, domains and functional sites in which identifiable features found in known proteins can be applied to new protein sequences in order to...
• Bio2RDF - GOA

  • api/sparql
  • application/x-ntriples
  • example/rdf+xml

  • 645 views
  • Pas couvert par une licence ouverte
  The Gene Ontology, or GO, is a major bioinformatics initiative to unify the representation of gene and gene product attributes across all species.
• Bio2RDF - NCBI Gene

  • api/sparql
  • application/x-ntriples

  • 477 views
  • Pas couvert par une licence ouverte
  NCBI Gene supplies gene-specific connections in the nexus of map, sequence, expression, structure, function, citation, and homology data. Unique identifiers are assigned to genes with...
• Pfam

  • api/sparql

  • 427 views
  • Pas couvert par une licence ouverte
• PDB

  • api/sparql

  • 336 views
  • Pas couvert par une licence ouverte
• UniSTS

  • api/sparql
  • application/x-ntriples

  • 99 views
  • Pas couvert par une licence ouverte
• Bio2RDF - GenBank

  • api/sparql
  • example/rdf+xml

  • 207 views
  • 
  The Entrez Nucleotide database is a collection of sequences from several sources, including GenBank, RefSeq, and PDB. The number of bases in these databases continues to grow at an...
• CAS

  • api/sparql

  • 123 views
  • Pas couvert par une licence ouverte
  RDFized version of the CAS database (or parts of it) provided by the bio2rdf project. The usage policies of the original source are found at http://www.cas.org/legal/infopolicy.html...
• Mouse Genome Database (MGD) from Mouse Genome Informatics (MGI)

  • api/sparql
  • application/x-ntriples

  • 201 views
  • Pas couvert par une licence ouverte
• Bio2RDF - HGNC

  • api/sparql
  • application/x-ntriples
  • application/x-nquads
  • example/rdf+xml

  • 435 views
  • 
  We have already approved over 24,000 symbols; the vast majority of these are for protein-coding genes, but also include symbols for pseudogenes, non-coding RNAs, phenotypes and genomic...
• Bio2RDF - HomoloGene

  • api/sparql
  • application/x-ntriples
  • example/rdf+xml

  • 249 views
  • Pas couvert par une licence ouverte
  HomoloGene, a tool of the National Center for Biotechnology Information (NCBI), is a system for automated detection of homologs (similarity attributable to descent from a common ancestor)...
• Bio2RDF - BioCYC

  • api/sparql
  • application/x-ntriples
  • example/rdf+xml

  • 53 views
  • 
  BioCyc is a collection of 371 Pathway/Genome Databases. Each Pathway/Genome Database in the BioCyc collection describes the genome and metabolic pathways of a single organism, with the...
• Reactome

  • api/sparql
  • application/x-ntriples

  • 231 views
  • Pas couvert par une licence ouverte
• PubMed

  • api/sparql
  • application/x-ntriples

  • 1509 views
  • Pas couvert par une licence ouverte
• KEGG Compound

  • 206 views
  • Pas couvert par une licence ouverte
• ProDom

  • api/sparql

  • 339 views
  • Pas couvert par une licence ouverte
• PubChem

  • api/sparql
  • example/rdf+xml

  • 351 views
  • Pas couvert par une licence ouverte
• Bio2RDF - Affymetrix

  • api/sparql
  • application/x-ntriples
  • example/rdf+xml

  • 339 views
  • 
  Affymetrix' GeneChip® technology was invented in the late 1980's by a team of scientists led by Stephen P.A. Fodor, Ph.D. The theory behind their work was revolutionary - a notion that...
• OBO

  • api/sparql
  • application/x-ntriples

  • 81 views
  • Pas couvert par une licence ouverte
• KEGG Drug

  • api/sparql
  • application/x-ntriples

  • 203 views
  • Pas couvert par une licence ouverte
• KEGG Pathway

  • api/sparql
  • application/x-ntriples

  • 285 views
  • Pas couvert par une licence ouverte
• KEGG Reaction

  • api/sparql
  • application/x-ntriples

  • 129 views
  • Pas couvert par une licence ouverte
• KEGG Enzyme

  • api/sparql

  • 213 views
  • Pas couvert par une licence ouverte
• UniProt

  • application/rdf+xml

  • 783 views
  • Pas couvert par une licence ouverte
  About Data exposed: a large life sciences data set Size of dump and data set: 3000M+ triples Openness Not open. Copyright page states: Copyright 2007-2012 UniProt Consortium. We...
• UniProt UniRef

  • application/rdf+xml
  • api/sparql
  • application/rdf+xml

  • 183 views
  • Pas couvert par une licence ouverte
  The UniRef databases provide clustered sets of sequences from UniProt Knowledgebase (including splice variants and isoforms) and selected UniParc records, in order to obtain complete...